Исследование, которое объясняет происхождение собак

This page contains affiliate links. We may earn money or products from the companies mentioned in this post through our independently chosen links, which earn us a commission. Learn More

Опубликовано Кришной Рамануджан. Переведено Александрой Сегал с письменного разрешения автора.

Basenji

Julia Randall
Genomic sequencing of genetically divergent dogs, such as this basenji from the Congo, together with wolves and other wild canids, provides rich information about the history of domestic dogs.

Собаки были одомашнены в период между 9 000 и 34 000 лет назад, учитывая, что самые ранние собаки, скорее всего, возникли, когда люди все еще охотились и жили племенами - до появления сельского хозяйства около 10 000 лет назад, согласно анализу отдельных геномов современных собак и серых волков.

Международная команда исследователей, опубликовавшая свой отчет в Genetics PLoS 16 января, изучила геномы трех серых волков - из Китая, Хорватии и Израиля - территории, которые считались возможными географическими центрами одомашнивания собак. Она также изучила геномы африканского басенджи и австралийского динго; обе породы возникли в местах, где не водились волки, соответственно, не могло произойти относительно недавнее смешение с ними.

Их результаты показали, что эти три волка были более тесно связаны друг с другом, чем с любой из собак. Аналогично, два генома собак и третий геном боксера имели более тесное отношение друг к другу, нежели в случае с волками. Это наводит на мысль о том, что современные собаки и серые волки напоминают больше сестринские ветви эволюционного дерева, спускающимся от более древнего, общего предка. Результаты сопоставимы с предыдущими теориями, доказывающими, что собаки произошли от одной из выборочных популяций серых волков.

«Это невероятно богатый новый набор данных, и он позволил нам провести самый подробный анализ генетической истории собак и волков», - сказал Адам Сипел, доцент биологической статистики и вычислительной биологии в Корнелле и соавтор статьи. «Существует еще много открытых вопросов, но это исследование тянет нас вперед», - добавил Зипель.

Компьютерные методы анализа полных последовательностей генома, разработанные Иланом Гронау, вторым автором статьи и докторантом в лаборатории Зипеля, сыграли ключевую роль в сотрудничестве. Компьютерная программа Гронау под названием G-PhoCS (обобщенный филогенетический коалесцентный образец) была ранее успешно применена в исследовании Nature Genetics в 2011 году, посвященном ранней истории человечества и демографии.

В данном случае G-PhoCS предоставила подробную картину демографических изменений, произошедших во время расхождения собак с волками. Анализ показал, что во время одомашнивания существовал значительный пробел в популяции ранних собак и волков. Собаки пережили шестнадцатикратное сокращение численности рода ввиду того, что они теряли связь родства с ранним предком волка. Серые волки также испытали резкие сокращения популяции, что говорит о том, что генетическое разнообразие общих предков обоих видов было куда значительнее, чем это представлено собаками и современными волками. Кроме того, наблюдался значительный поток генов между собаками и волками после одомашнивания. Учет потока генов был серьезной проблемой в анализе, и исследования Гронау по этой теме оказались ценными для получения точной модели демографии собак.

Картина, появившаяся в результате этого исследования, позволит исследователям лучше обосновывать генетические различия, наблюдаемые между собаками и волками, и выявлять различия, обусловленные естественным отбором. «Это исследование создает предпосылки для следующего шага в изучении одомашнивания собак, который пытается определить генетические изменения, которые позволили осуществить эту удивительную трансформацию», - сказал Гронау.

Главными авторами исследования были генетики Джон Новембре из Чикагского университета и Роберт Уэйн из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе (UCLA). Адам Фриман, аспирант в Лос-Анджелесе, был первым автором статьи. Адам Бойко, доцент кафедры биомедицинских наук Корнелла, также был соавтором этой статьи.

Исследование финансировалось различными источниками, включая Национальный научный фонд, Национальные институты здравоохранения и Технологию Жизни.

Поправка от 13 февраля 2014 года: в оригинальной версии рассказа неправильно указано: «Анализ показал, что одомашнивание привело к значительному пробелу в популяции ранних собак и волков». Исследование фактически показало, что достаточно трудно было определить, насколько сильно одомашнивание повлияло на сокращение численности рода и насколько данное сокращение зависело от изменения климата или среды обитания. Предложение было изменено: «Анализ показал, что во время одомашнивания произошел значительный пробел в популяции ранних собак и волков».